【期刊年份】 2022年第02期
【作者姓名】乔娇灵¹   朱绪伟²   段竹君¹   李莹¹   杨新峰²   段建平¹
【作者单位】¹南阳师范学院   ²河南省蚕业科学研究院

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摘   要   目前，一化性柞蚕基因组图谱不完整，缺Ｗ染色体未被组装，而Ｗ染色体是柞蚕雌性个体最重要的一条性染色体。为辅助柞蚕雌性个体基因组组装策略的制定，基于二代高通量测序，结合划动窗口统计、ｋ－ｍｅｒ曲线拟合及基因组从头组装等手段，对柞蚕雌性个体基因组的ＧＣ含量、杂合度、基因组大小等特征进行了分析。结果发现一化性柞蚕雌性个体基因组ＧＣ含量约为３６％，杂合度约为１２５％，从头组装获得的基因组由８５２５１９条ｓｃａｆｆｏｌｄ组成，总大小约为７６０Ｍｂ。说明一化性柞蚕雌性个体基因组属于高复杂度基因组，单纯二代数据组装的基因组质量较差，需要利用三代测序及染色体构象捕获技术，保证将来雌性个体基因组组装质量。
关键词   柞蚕；雌性个体；基因组；杂合度；ＧＣ含量；测序